De vlag van Estland bestaat vandaag, 4 juni 2025, precies 141 jaar. Dit feit werd gevierd met een ceremonie in Kuberneriaed in Tallinn, een tuin nabij Pikk Hermann, de toren waar jaarlijks op Onafhankelijkheidsdag de vlag gehesen wordt.
De eerste versie van de blauw-zwart-witte vlag werd in 1884 gemaakt, maar het idee ontstond eerder. In 1870 werd in Tartu de eerste studentenvereniging voor Estssprekenden opgericht. In 1881 kozen ze drie nieuwe symbolische kleuren voor hun organisatie; blauw, zwart en wit. In de jaren erna werd de vlag steeds vaker geassocieerd met het Estse nationalisme. Daarnaast had de Estssprekende gemeenschap de vlag al geadopteerd als nieuwe nationale vlag.
Hoewel Estland op 24 februari 1918 de onafhankelijkheid uitriep, werd de vlag pas op 21 november 1918 tot officiële vlag bestempeld door de tijdelijke Estse regering. Op 12 december in hetzelfde jaar werd de vlag voor het eerst als officiële vlag gehesen op de toren Pikk Hermann. Het besluit werd in 1922 in de wet vastgelegd. Sindsdien is de blauw-zwart-witte vlag de enige officiële vlag van Estland.
Dat duurde overigens niet lang. In juni 1940 trok het Sovjetleger Estland binnen en werd de vlag verbannen uit het straatbeeld. De Sovjets haalden de vlag van Pikk Hermann en hesen deze naast de rode vlag van de Sovjet-Unie. Nog geen maand later verdween de driekleur van de toren. Tijdens de Duitse bezetting, tussen 1941 en 1944 accepteerde de nieuwe bezetter de vlag als “vlag van het Estse volk”, maar niet van het land Estland. Nadat de Duitsers in september 1944 Estland verlieten, werd de Estse vlag weer gehesen op Pikk Hermann.
Nog dezelfde maand werd deze weer verwijderd door de Sovjets, die nogmaals Estland bezetten. Tijdens deze bezetting was het tonen of verspreiden van de Estse vlag strafbaar. Tot laat in de jaren ’80 werd er streng gehandhaafd. Dit duurde tot 1987; tijdens een openbare bijeenkomst de Estse vlag zichtbaar was en de Sovjets niet ingrepen. Dat leidde ertoe dat op 24 februari 1989 de driekleur voor het eerst sinds 1944 weer werd gehesen op Pikk Hermann. Op 7 augustus 1990, toen Estland formeel nog bezet werd door de Sovjet-Unie, nam het land de vlag weer aan als officiële landsvlag.
De vlag uit 1884 is bewaard gebleven en te zien in het Ests Nationaal Historisch Museum in Tartu. Het is de oudst bewaarde nationale vlag ter wereld.